<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Avicenna Journal of Clinical Medicine</title>
<title_fa>مجله پزشكي باليني ابن سينا</title_fa>
<short_title>Avicenna J Clin Med</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-722X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-7238</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.53208/ajcm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>-</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>24</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>فراوانی گونه های آکانتامبا  در آب استخرها و حوضچه های شهر خرم آباد و تعیین ژنوتیپ های آن درسال 1395</title_fa>
	<title>Frequency and Genotyping of Acanthamoeba Species in the Swimming Pools and Ponds of Khoramabad, Iran, in 2016</title>
	<subject_fa>سایر تخصص هاي باليني</subject_fa>
	<subject>Other Clinical Specialties</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original </content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position: relative; top: -1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: rgb(39, 76, 195);&quot;&gt;سابقه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;آکانتامبا آمیبی فرصت&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;طلب ساکن آب، خاک و هوا است. این آمیب می&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;تواند در افراد دارای نقص سیستم ایمنی باعث آنسفالیت آمیبی گرانولوماتوز و در افرادی که ازلنز تماسی چشم استفاده می&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;کنند ایجاد کراتیت آمیبی کند. تعدادی از ژنوتیپ&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;های آکانتامبا بیماری&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;زا و برخی غیر بیماری&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;زا هستند. این مطالعه باهدف تعیین فراوانی و شناسایی ژنوتیپ های آکانتامبا در آب استخرها وحوضچه&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;های شهر خرم آباد با روش&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;های کشت، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; و توالی یابی در&amp;nbsp; سال 1395 انجام شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position: relative; top: -1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: rgb(39, 76, 195);&quot;&gt;مواد و روش&#8204;&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;تعداد 84 نمونه از آب استخرها و حوضچه&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;های خرم&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;آباد جمع&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;آوری شد. نمونه&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;ها از فیلترهای سرنگی نیتروسلولز 45/0 میکرونی عبور داده شده و سپس فیلتر در محیط کشت آگار غیرمغذی 5/1 درصد پوشیده با باکتری کشته&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;شده&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; اشریشیا کلی و دمای&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;C&lt;/span&gt;&lt;sup&gt;&amp;deg;&lt;/sup&gt;27کشت داده شدند. پس از استخراج &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt; ازنمونه&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;های مثبت،جهت شناسایی آکانتامبا واکنش&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; با استفاده از پرایمرهای اختصاصی صورت گرفت. به منظورتعیین ژنوتیپ&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;های آکانتامبا،محصول &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;نمونه&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;های مثبت تعیین توالی گردید&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position: relative; top: -1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: rgb(39, 76, 195);&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;از84 نمونه آب جمع&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;آوری شده از استخرها و حوضچه&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;های شهر خرم&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;آباد تعداد 50 نمونه(5/59%) دارای نتیجه کشت مثبت بودند که پس از استخراج &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt; و انجام &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; 35 نمونه(7/41%) از نظر آکانتامبا مثبت بودند. پس از تعیین توالی محصولات&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;، مشخص شد که 17 نمونه دارای ژنوتیپ&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;T4&lt;/span&gt; (57/48%) و 18 نمونه (42/51%) دارای سایر ژنوتیپ های آکانتامبا می&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;باشند.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;position: relative; top: -1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: rgb(39, 76, 195);&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;این مطالعه نشان داد شیوع بالای انواع آکانتامبا، بخصوص نوع بیماریزای آن، در استخرهای خرم آباد می تواند منشاء آلودگی برای انسان باشد. حدود نیمی از ژنوتیپ&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;های یافت شده از نوع بیماری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;زا (ژنوتیپ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;T4&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;) وعامل اصلی کراتیت آکانتامبایی می&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;باشند. این منابع آبی به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;عنوان عامل بالقوه خطر برای سلامت عمومی بوده و تلاش متصدیان بهداشتی به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;منظورآموزش و پیشگیری از آلودگی ضروری است&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and Objective:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; is a free-living and opportunistic amoeba found in the water, soil, and air. This amoeba causes granulomatous&amp;nbsp;amoebic&amp;nbsp;encephalitis in the immunocompromised patients and amoebic keratitis in the people using contact lenses. The genotypes of &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; are pathogenic and non-pathogenic. Regarding this, the present study aimed to determine the frequency and genotypes of &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; in the water pools and ponds of Khorramabad, Iran, using culture, polymerase chain reaction (PCR), and sequencing methods in 2016&lt;em&gt;.&lt;/em&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods:&lt;/strong&gt; This study was conducted on a total of 84 water samples collected from the water pools and ponds of Khorramabad. The samples were filtered using nitrocellulose syringe (0.45 &amp;mu;m); subsequently, they were cultured on 1.5% non-nutrient agar, covered by killed &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; and incubated at 27&amp;ordm;C. After the extraction of DNA from positive samples, PCR was performed using specific primers to detect and confirm &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt;. Then, for genotyping, the PCR products of positive samples were sequenced.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Out of the 84 water samples, 50 (59.5%) cases were positive for amoeba in the culture method. However, the results of the PCR revealed 35 (41.7%) positive samples for &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt;. The sequencing of the PCR products demonstrated that 17 samples were &lt;em&gt;T4&lt;/em&gt; genotype (pathogen), and the rest were other &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; genotypes.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; This study indicated the high prevalence of &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; species, especially the pathogenic type, in the water pools of Khoramabad that could be a source of infection risk for humans&lt;em&gt;.&lt;/em&gt; Regarding the fact that almost half of the found genotypes were pathogenic (genotype &lt;em&gt;T4&lt;/em&gt;) that are the main cause of amoebic keratitis, these water bodies could be a potential risk factor for the public health. Therefore, the health professionals should prevent contamination.&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>آب, آکانتامبا, ژنوتیپ, واکنش زنجیره ای پلیمراز</keyword_fa>
	<keyword>Acanthamoeba, Genotype, Polymerase Chain Reaction, Water</keyword>
	<start_page>236</start_page>
	<end_page>243</end_page>
	<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-12-83-12&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>M</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Faraji </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مجید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فرجی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846007151</code>
	<orcid>10031947532846007151</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی همدان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>A</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Maghsood </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>امیر حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مقصود</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846007152</code>
	<orcid>10031947532846007152</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی همدان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fallahi Fallahi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شیرزاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فلاحی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846007153</code>
	<orcid>10031947532846007153</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی لرستان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>A</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Chegeni Sharafi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>چگنی شرفی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846007154</code>
	<orcid>10031947532846007154</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی لرستان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>A</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Karimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آزاده</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کریمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846007155</code>
	<orcid>10031947532846007155</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی لرستان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Z</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Lasjerdi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زهره</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>لاسجردی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846007156</code>
	<orcid>10031947532846007156</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>M</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fallah </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فلاح</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>fallah@umsha.ac.ir</email>
	<code>10031947532846007157</code>
	<orcid>10031947532846007157</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Hamadan University of Medical Sciences</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی همدان</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
