<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Avicenna Journal of Clinical Medicine</title>
<title_fa>مجله پزشكي باليني ابن سينا</title_fa>
<short_title>Avicenna J Clin Med</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-722X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-7238</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.53208/ajcm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>-</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1383</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2004</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>11</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مطالعه سه روش خالص سازی HBV DNA جهت استفاده در تکنیک PCR</title_fa>
	<title>Study the Three Extraction Methods for HBV DNA to Use in PCR</title>
	<subject_fa>سایر تخصص هاي باليني</subject_fa>
	<subject>Other Clinical Specialties</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original </content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;&amp;nbsp; تشخیص هپاتیت &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;B&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; با توجه به فراوانی میزان عفونت ناشی از آن از اهمیت ویژه ای برخوردار است. در بین روشهای تشخیصی، اخیرا تکنیک &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; بیش از پیش مورد توجه قرار گرفته است. گزارش های ارائه شده در مراکزی که از این تکنیک استفاده مینمایند حاکی از وجود برخی از موارد منفی کاذب میباشد. هدف از انجام این مطالعه بررسی مقایسه ای بین روشهای خالص سازی رایج میباشد تا ضمن آگاهی از میزان کارایی هر یک بهترین روش شناسایی گردد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; از 30 نمونه دریافتی از بیماران مراجعه کننده به درمانگاه هپاتیت بیمارستان شریعتی تهران که مبتلا به هپاتیت مزمن بوده و &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;HBs&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; آنتی ژن مثبت و &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;HBe&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; آنتی ژن منفی بودند نمونه سرم تهیه گردید. استخراج &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;HBV DNA&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; با سه روش توسعه یافته جوشاندن بعنوان یک روش سریع، روش فنل کلروفرم بعنوان یک روش دقیق، و روش خالص سازی مبتنی بر گوانیدیوم هیدروکلراید انجام گردید. کیت&lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; برای&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt; &lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;تشخیص&amp;nbsp;هپاتیت از شرکت سیناژن استفاده گردید که شامل آنزیم &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;taq&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; پلیمراز و مخلوط واکنشی متشکل از پرایمر &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;dNTP&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; و بافر واکنش بود. پروتکل &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; مزبور قادر به تکثیر محصولی به طول &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;bp&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; 353 بود.&amp;nbsp;سپس با چرخه گرمایی مناسب نمونه ها با واکنش &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; تکثیر گردید و محصول &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; در سه روش مقایسه شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; نتایج بدست آمده در مرحله اول موید موفقیت پروتکل استفاده شده در تشخیص &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; هپاتیت &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;B&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; در سرم بود. همچنین&amp;nbsp;میزان موارد مثبت روش جوشاندن ، روش فنل کلروفرم و کیت خالص سازی به ترتیب&amp;nbsp;19،16 و 23 و موارد منفی به ترتیب 14، 11 و 7 مورد بود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; روش PCR&amp;nbsp;&amp;nbsp;سریعترین و دقیق ترتین روش جهت شناسایی بیماران بوده و روش تخلیص DNA&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 10pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;توسط گوانیدیوم هیدروکلراید در ویروس ها موفقیت آمیز ترین روش بکار رفته در این بررسی است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span -webkit-text-stroke-width:=&quot;&quot; background-color:=&quot;&quot; color:=&quot;&quot; font-size-adjust:=&quot;&quot; font-stretch:=&quot;&quot; id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList2_ctl00_abstractLabel0&quot; letter-spacing:=&quot;&quot; new=&quot;&quot; style=&quot;font: 12pt/17pt &quot; text-indent:=&quot;&quot; text-transform:=&quot;&quot; times=&quot;&quot; white-space:=&quot;&quot; widows:=&quot;&quot; word-spacing:=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;Diagnosis of Hepatitis B is important because of the its high prevalence.&amp;nbsp;Recently PCR method , has found greater interest among different&amp;nbsp;diagnostic methods. Several reports emphasis on some false negative results&amp;nbsp;in those laboratories using PCR. The aim of this study was to compare three&amp;nbsp;different procedures for HBV DNA extraction.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span -webkit-text-stroke-width:=&quot;&quot; background-color:=&quot;&quot; color:=&quot;&quot; font-size-adjust:=&quot;&quot; font-stretch:=&quot;&quot; id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList2_ctl00_abstractLabel0&quot; letter-spacing:=&quot;&quot; new=&quot;&quot; style=&quot;font: 12pt/17pt &quot; text-indent:=&quot;&quot; text-transform:=&quot;&quot; times=&quot;&quot; white-space:=&quot;&quot; widows:=&quot;&quot; word-spacing:=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; A total 30 serum samples received from Shariati hospital. Sera was&amp;nbsp;taken from patients having chronic Hepatitis with HBs antigen positive and&amp;nbsp;HBe antigen negative. The sensitivity of guanidium hydrochloride method for&amp;nbsp;extracting the HBV DNA from serum were evaluated and compared&amp;nbsp;with phenol&amp;ndash;chloroform and boiling methods. Diagnostic PCR kit was&amp;nbsp;obtained from Cynagene contained taq polymerase, reaction mixture,&amp;nbsp;dNTP, and buffer for reaction. A 353 bp product were amplified by&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&amp;nbsp; amplification program provided in&amp;nbsp;used PCR protocol.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span -webkit-text-stroke-width:=&quot;&quot; background-color:=&quot;&quot; color:=&quot;&quot; font-size-adjust:=&quot;&quot; font-stretch:=&quot;&quot; id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList2_ctl00_abstractLabel0&quot; letter-spacing:=&quot;&quot; new=&quot;&quot; style=&quot;font: 12pt/17pt &quot; text-indent:=&quot;&quot; text-transform:=&quot;&quot; times=&quot;&quot; white-space:=&quot;&quot; widows:=&quot;&quot; word-spacing:=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; The comparison of results indicated that procedure was successful for&amp;nbsp;amplification of the designed products from Hepatitis B in sera. Number of&amp;nbsp;positive results were 16,19,23 and number of negative result were 14,11,7 for&amp;nbsp;the boiling, phenol-chloroform and guanidium-hydrochloride extraction&amp;nbsp;methods respectively.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span -webkit-text-stroke-width:=&quot;&quot; background-color:=&quot;&quot; color:=&quot;&quot; font-size-adjust:=&quot;&quot; font-stretch:=&quot;&quot; id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList2_ctl00_abstractLabel0&quot; letter-spacing:=&quot;&quot; new=&quot;&quot; style=&quot;font: 12pt/17pt &quot; text-indent:=&quot;&quot; text-transform:=&quot;&quot; times=&quot;&quot; white-space:=&quot;&quot; widows:=&quot;&quot; word-spacing:=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; PCR method is the fastest diagnosis method and the most accurate&amp;nbsp;procedure to identify Hepatitis B. Guanidium hydrochloride method was the&amp;nbsp;most successful procedure studied in this survey for viruses.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>اسید نوکلئیک , واکنش زنجیره پلیمراز , هپاتیت B</keyword_fa>
	<keyword>Hepatitis B , Nucleic Acid , Polymerase Chain Reaction</keyword>
	<start_page>10</start_page>
	<end_page>14</end_page>
	<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-2-539&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nasrin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sheikh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نسرین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شیخ</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460013843</code>
	<orcid>100319475328460013843</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Masoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hajia</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حاجیا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460013844</code>
	<orcid>100319475328460013844</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ashraf</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mohammadkhani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اشرف</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>محمدخانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460013845</code>
	<orcid>100319475328460013845</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name></first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name></last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کورکی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460013846</code>
	<orcid>100319475328460013846</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
