<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Avicenna Journal of Clinical Medicine</title>
<title_fa>مجله پزشكي باليني ابن سينا</title_fa>
<short_title>Avicenna J Clin Med</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-722X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-7238</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.53208/ajcm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>-</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2016</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>23</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تعیین الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیکی و بررسی موتاسیون در ژن‌های gyrA و parC  در سویه‌های اشریشیاکلی جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت ادراری </title_fa>
	<title>Study of Antibiotic Resistance Pattern and Mutation in Genes gyrA and parC of Escherichia Coli Causing Urinary Tract Infection</title>
	<subject_fa>سایر تخصص هاي باليني</subject_fa>
	<subject>Other Clinical Specialties</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original </content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;مقدمه و هدف:&lt;/strong&gt; فلوروکینولون&amp;shy;ها یکی از آنتی&#8204;بیوتیک&amp;shy;های رایج در شروع درمان تجربی عفونت ادراری می&#8204;باشند اما به علت ایجاد جهش در ژن&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrA&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt; که کد کننده&#8204;ی آنزیم&#8204;های هدف فلوروکینولون&amp;shy;ها هستند مقاومت چشمگیری نسبت به این عوامل ضد میکروبی به دست آورده&#8204;اند. این مطالعه با هدف تعیین الگوی مقاومت آنتی&amp;shy;بیوتیکی و بررسی جهش&amp;shy;های رخ داده در ژن&amp;shy;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrA&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt; اشریشیاکلی&amp;shy;های عامل عفونت ادراری انجام گردید.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;روش&amp;shy; کار:&lt;/strong&gt; مطالعه حاضر در سال 1392 بر روی 135 نمونه از عفونت ادراری در آزمایشگاه بیمارستان الزهرا (س) اصفهان انجام گرفت. شناسایی باکتری بر اساس روش&amp;shy;های میکروب&amp;shy;شناسی و بررسی الگوی مقاومت آنتی&amp;shy;بیوتیکی به روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Kirby bauer&lt;/span&gt; انجام شد. سپس &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt; ایزوله&#8204;های مقاوم به فلوروکینولون&amp;shy;ها با روش جوشاندن استخراج گردید و واکنش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; و تعیین توالی جهت ردیابی جهش&amp;shy;های رخ داده در ژن&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrA&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt; انجام شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;نتایج:&lt;/strong&gt; از مجموع 135 ایزوله اشریشیاکلی مورد آزمایش، 61 ایزوله (45%) مقاوم به فلوروکینولون&amp;shy;ها بوده و همگی واجد ژن&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrA&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt; بودند. نتایج تعیین توالی 13 ایزوله مقاوم به فلوروکینولون&amp;shy;ها نشان داد که همه ایزوله&#8204;ها دارای حداقل یک جهش در ژن&#8204;های مذکور هستند. در سایر ایزوله&#8204;ها جهش در ژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrA&lt;/span&gt; به&#8204; صورت &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Ser83Leu&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Asp87Asn&lt;/span&gt; مشاهده شد و جهش در ژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt; نیز به شکل &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;GLy78Ser&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Ser80Ile&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Ser80VaL&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Ser80Arg&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;GLu84VaL&lt;/span&gt; مشاهده شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;نتیجه&amp;shy; نهایی:&lt;/strong&gt; نتایج به&#8204;دست&#8204;آمده از توالی&amp;shy;یابی ژن&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrA&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt; در این بررسی نشان دهنده بروز جهش&#8204;هایی بود که باعث ایجاد مقاومت بالا نسبت به فلوروکینولون&amp;shy;ها می&#8204;گردند. برای غلبه بر این مشکل، باید تجویز بی&#8204;رویه محدود گردد و تجویز آنتی&#8204;بیوتیک بر اساس الگوهای حساسیت میکروارگانیسم صورت گیرد.&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Introduction &amp; Objective:&lt;/strong&gt; Fluoroquinolones are essential antimicrobial agents used to treat UTIs. Clinical experiences have shown a high rate of antibiotic resistance among uropathogens. These resistance are usually the consequence of mutations involving genes encoding gyrA and parC. The aim of this study was to determine antimicrobial resistance pattern and the presence of mutations in regions that code for quinolone resistance in the genes gyrA and parC in clinical isolates of E. coli from a hospital in Isfahan, Iran.&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Materials &amp; Methods:&lt;/strong&gt; A total of 135 isolates of E.coli (from urine) were collected from September to February 2013 from Alzahra Hospital (Isfahan, Iran). Bacterial susceptibility to antimicrobial agents was determined using disk diffusion method. PCR was performed to detect genes gyrA and parC. Then, 13 isolates were randomly chosen for genetic characterization of the quinolone-determining region (QRDR) of the parC and gyrA genes.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Among 135 E. coli isolates, 61 isolates ( 45 % ) were resistant to fluoroquinolones. From 13 isolates, 11 isolates showed two mutations (Ser83Leu/ Asp87Asn) and 2 isolates showed a single mutation (Ser83Leu) in gyrA gene. Also, five different mutations were detected in parC gene in the E. coli isolates, encoding Ser80Ile, Ser80Val, Ser80Arg, Glu84Val, Gly78Ser.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Conclusion: &lt;/strong&gt;More research on the molecular basis of FQ resistance is required to develop new therapeutic strategies for FQ-resistant E. coli. To overcome antibiotic resistance antibiotic therapy should be limited and based on the susceptibility patterns of microorganisms.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیاکلی, ژن ها , عفونت دستگاه ادراری , فلوروکینولون</keyword_fa>
	<keyword>Esherichial coli , Fluorouinolone , Genes , Urinary Tract Infection </keyword>
	<start_page>118</start_page>
	<end_page>125</end_page>
	<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-153-5&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>J.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Faghri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جمشید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فقری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846004444</code>
	<orcid>10031947532846004444</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>R.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dehbanipour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>راضیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دهبانی پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846004445</code>
	<orcid>10031947532846004445</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>S.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mobasherizadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سینا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مباشری زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846004446</code>
	<orcid>10031947532846004446</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>N.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Maleki</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نفیسه </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ملکی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846004447</code>
	<orcid>10031947532846004447</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
