<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Avicenna Journal of Clinical Medicine</title>
<title_fa>مجله پزشكي باليني ابن سينا</title_fa>
<short_title>Avicenna J Clin Med</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-722X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-7238</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.53208/ajcm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>-</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>24</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>other</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی سریع باکتری کمپیلو باکتر ژژونی بر اساس واکنش PCR و ارزیابی حساسیت و اختصاصیت آن</title_fa>
	<title>Rapid Detection of Campylobacter jejuni by Polymerase Chain Reaction and Evaluation of its Sensitivity and Specificity</title>
	<subject_fa>سایر تخصص هاي باليني</subject_fa>
	<subject>Other Clinical Specialties</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original </content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align:justify;line-height:150%;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family: tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;مقدمه:&lt;/strong&gt; کمپیلوباکتر ژژونی از عوامل اصلی و شایع مسمومیت غذایی در انسان است. شناسایی سریع و اختصاصی این باکتری نقش مهمی در تشخیص و درمان عفونت ایفا می&#8204;کند. هدف از این مطالعه طراحی واکنش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; اختصاصی به منظور شناسایی کمپیلو باکتر ژژونی می&#8204;باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align:justify;line-height:150%;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family: tahoma;&quot;&gt;روش کار: در این مطالعه تجربی ژن اکسیدو ردوکتاز از باکتری کمپیلو باکتر ژژونی جهت شناسایی سریع و اختصاصی این باکتری انتخاب گردید. پرایمرهای اختصاصی جهت این کار، طراحی و خصوصیات آن توسط نرم افزارهای بیو انفورماتیکی بررسی گردید. &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt; باکتری با روش فنل کلروفرم استخراج شد. اختصاصیت روش طراحی شده، با استفاده از 6 گونه باکتری بررسی شد. حساسیت واکنش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; با روش تهیه سریال رقت از ژنوم باکتری محاسبه شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align:justify;line-height:150%;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family: tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/strong&gt; نتایج نشان داد که پرایمر طراحی شده کاملاً اختصاصی ژن اکسیدوردوکتاز باکتری کمپیلو باکتر ژژونی بوده و پس از انجام &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; تک باند 167 جفت بازی تکثیر می&#8204;شود. این پرایمر با ژنوم دیگر گونه&#8204;های باکتریایی جفت نمی&#8204;شود. حد تشخیص این واکنش 5 پیکوگرم از &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt; ژنومی باکتری می&#8204;باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family: tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;نتیجه گیری:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; روش بهینه شده در این مطالعه روشی سریع، حساس و اختصاصی به منظور تشخیص کمپیلو باکتر می&#8204;باشد. به منظور تأیید نتایج این مطالعه، تشخیص باکتری کمپیلو باکتر ژژونی در نمونه&#8204;های مواد غذایی توصیه می&#8204;شود&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Introduction:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;Campylobacter jejuni&lt;/em&gt; is one of the most common causes of food poising in humans. Rapid and specific detection of these bacteria has an important role in diagnosis and treatment of infection. The aim of this study was to design a specific PCR for the detection of &lt;em&gt;Campylobacter jejuni&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Methods:&lt;/strong&gt; In this experimental study, oxidoreductase gene from the &lt;em&gt;Campylobacter jejuni&lt;/em&gt; was selected for rapid and specific detection. For this purpose, specific primers were designed and charecterized by bioinformatics software. Bacterial genome was extracted by phenol-chloroform method and PCR was optimized to obtain a specific product. Specificity of the designed reaction was investigated using six bacterial species. The sensitivity of the PCR reaction was calculated by the serial dilutions method&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; The designed primer was specific to oxidoreductase gene of &lt;em&gt;Campylobacter jejuni&lt;/em&gt; and after optimization, a unique 167-bp band was amplified&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt; This primer was specific to &lt;em&gt;Campylobacter jejuni&lt;/em&gt; and did not show any cross reaction with other bacterial genomes. The detection limit of this reaction was 5 pg of genomic DNA&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Conclusions:&lt;/strong&gt; The optimized PCR used in this study was a rapid, sensitive, and specific method for detection of &lt;em&gt;Campylobacter jejuni&lt;/em&gt;. For confirmation of this method, detection of C. jejuni from food samples is proposed&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>اکسیدو ردوکتاز, کمپیلو باکتر ژژونی- تشخیص, واکنش زنجیره پلیمراز</keyword_fa>
	<keyword>Campylobacter jejuni- diagnosis, Oxidoreductase, Polymerase Chain Reaction</keyword>
	<start_page>56</start_page>
	<end_page>62</end_page>
	<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-615-10&amp;slc_lang=other&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>A</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Razei</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رضیئی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846006140</code>
	<orcid>10031947532846006140</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Bqiyatallah University of Medical Sciences</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>R</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sorouri </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رحیم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سروری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rsorouriz@gmail.com</email>
	<code>10031947532846006141</code>
	<orcid>10031947532846006141</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Bqiyatallah University of Medical Sciences</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>H</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Aghamollaei </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>آقاملایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846006142</code>
	<orcid>10031947532846006142</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Bqiyatallah University of Medical Sciences</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>SL</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mousavi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>میرلطیف</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>موسوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846006143</code>
	<orcid>10031947532846006143</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Shahed University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه شاهد</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
