<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Avicenna Journal of Clinical Medicine</title>
<title_fa>مجله پزشكي باليني ابن سينا</title_fa>
<short_title>Avicenna J Clin Med</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-722X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-7238</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.53208/ajcm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>-</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>25</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تشخیص ملکولی ژن‌های بیماری‌زا در سویه‌های ‌سودوموناس ‌آئروژینوزای جداشده از نمونه‌های بالینی با روش ‌Multiplex PCR</title_fa>
	<title>Molecular Detection of Virulence Genes among Pseudomonas aeruginosa Strains Isolated from Clinical Specimens by Multiplex PCR</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original </content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;letter-spacing:.2pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;سابقه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; رایج&#8204;ترین پاتوژن مرتبط با عفونت&#8204;های بیمارستانی است که دارای فاکتورهای بیماری&#8204;زایی نظیر آلژینات، اگزوآنزیم &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;S&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، اگزوتوکسین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و الاستاز که در تهاجم و سمیت باکتری مشارکت دارند می&#8204;باشد. در این ارتباط، هدف از مطالعه حاضر شناسایی شیوع ژن&#8204;های &amp;rlm;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;algD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;exoS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;toxA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;lasB&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;در سویه&#8204;های &lt;em&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/em&gt;ی &amp;rlm;جداشده از بیماران با روش ملکولی &amp;rlm;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Multiplex PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;rlm; (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Multiplex Polymerase Chain Reaction&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) می&#8204;باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;مواد و روش&#8204;&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;در این مطالعه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;مقطعی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; 60 نمونه بالینی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;سودو&lt;em&gt;موناس آئروژینوزا &lt;/em&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;از بیمارستان&#8204;های دی و مطهری تهران &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;جمع&#8204;آوری گردید. پس از تأیید ایزوله&#8204;ها با روش&#8204;های بیوشیمیایی، آزمون آنتی&#8204;بیوگرام به روش دیسک دیفیوژن (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Disk&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Diffusion&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) با آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;های مختلف انجام شد. علاوه&#8204;براین، واکنش &amp;rlm;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Multiplex PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;rlm; جهت شناسایی ژن&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;lrm;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;های&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;lrm;&amp;lrm;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; مورد نظر &amp;rlm;به کار رفت.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;از 60 نمونه جمع&#8204;آوری&#8204;شده، 37 بیمار مرد (66/61 درصد) و 23 بیمار &amp;rlm;زن (34/38 درصد) دارای عفونت &lt;em&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/em&gt; بودند. بیشترین سطح مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی ایزوله&#8204;های &lt;em&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/em&gt; علیه &amp;rlm;سفتریاکسون (33/93 درصد) مشاهده شد. میزان شیوع ژن&#8204;های بیماری&#8204;زا در ایزوله&#8204;ها نیز عبارت بود از: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;lasB&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; (7/61 درصد)، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;toxA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; (60 درصد)، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;algD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; (3/43 درصد) و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;exoS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; (5 درصد).&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;الاستاز، اگزوتوکسین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و آلژینات فاکتورهای مهم بیماری&#8204;&amp;zwj;&#8204;زای &lt;em&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/em&gt; هستند و نقش اصلی را در ایجاد بیماری&#8204;ها و آسیب&#8204;های بافتی و پوستی ایفا می&#8204;کنند. &amp;rlm;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and Objective:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;Pseudomonas aeroginosa &lt;/em&gt;is the most common pathogen associated with nosocomial infections and possesses virulence factors which contribute to the bacterial invasion and toxicity such as alginate, exoenzyme S, exotoxin A and elastase. The aim of this study was to determine the prevalence of&lt;em&gt; algD, exoS, toxA&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;lasB&lt;/em&gt; genes in &lt;em&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt; samples isolated from patients by Multiplex PCR.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods:&lt;/strong&gt; In this cross sectional study, sixty clinical samples were collected from Dey and Motahhari Hospitals, Tehran, Iran. Following identification of isolates by biochemical methods, Antibiogram test was performed using disc diffusion method with different antibiotics. Multiplex PCR method was performed to identify the desired genes.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; 37 out of 60 (61.66%) male and 23 out of 60 (38.34%) female specimens were positive for &lt;em&gt;pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt;. The highest level of antibiotic resistance of the &lt;em&gt;Pseudomonas aeroginosa &lt;/em&gt;isolates was observed against ceftriaxone (93.33%). The prevalence rate of virulence genes among all isolates was as follows; &lt;em&gt;lasB&lt;/em&gt; (61.7%), &lt;em&gt;toxA &lt;/em&gt;(60%), &lt;em&gt;algD&lt;/em&gt; (43.3%) and &lt;em&gt;exoS&lt;/em&gt; (5%).&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; Elastase, exotoxin A and alginate are considered important virulence factors of &lt;em&gt;pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt; and they play a major role in causing diseases and tissue and skin lesions.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>ژن‌ها, سودوموناس آئروژینوزا, واکنش زنجیره پلیمراز</keyword_fa>
	<keyword>Genes, Multiplex PCR, Pseudomonas aeruginosa</keyword>
	<start_page>28</start_page>
	<end_page>34</end_page>
	<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-12-927-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Afsoon </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shariat</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>افسون</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شریعت</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>afsoonsh1980@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846008268</code>
	<orcid>10031947532846008268</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Assistant Professor, Department of Microbiology,  School of Basic Sciences, Kazerun Branch, Islamic Azad University, Kazerun, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار، گروه میکروب‌شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sajad </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alizadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سجاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>علیزاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008269</code>
	<orcid>10031947532846008269</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>PhD Student, Department of Microbiology School of Basic Sciences, Kazerun Branch, Islamic Azad University, Kazerun, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mehdi </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Jahangiri Hoseinabadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جهانگیری حسین‌آبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008270</code>
	<orcid>10031947532846008270</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>PhD Student, Department of Microbiology School of Basic Sciences, Kazerun Branch, Islamic Azad University, Kazerun, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Movagharnejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>موقرنژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008271</code>
	<orcid>10031947532846008271</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>PhD Student, Department of Microbiology School of Basic Sciences, Kazerun Branch, Islamic Azad University, Kazerun, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
