<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Avicenna Journal of Clinical Medicine</title>
<title_fa>مجله پزشكي باليني ابن سينا</title_fa>
<short_title>Avicenna J Clin Med</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-722X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-7238</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.53208/ajcm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>-</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>26</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی مقاومت آنتی‌بیوتیکی در جدایه‌های اشریشیاکلی از موارد عفونت‌های ادراری در شهرستان بجنورد</title_fa>
	<title>Phenotypic and Genotypic Study of Antibiotic Resistance among Escherichia coli Isolates from Human Urinary Infection Cases in Bojnord Province</title>
	<subject_fa>ميكروب شناسی و ویروس شناسی پزشكي</subject_fa>
	<subject>Microbiology &amp; Medical Virology</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original </content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-family:tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;سابقه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;letter-spacing:.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;شایع&#8204;ترین عوامل ایجاد&#8204;کننده عفونت ادراری، عوامل باکتریایی می&#8204;باشند که در این میان، باکتری &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; یکی از عوامل مهم در ایجاد این بیماری است. در این راستا، مطالعه حاضر با هدف تعیین میزان مقاومت باکتری&lt;em&gt; اشریشیاکلی&lt;/em&gt; نسبت به آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;های گروه&#8204;های گوناگون در موارد عفونت ادراری انجام شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;مواد و روش&#8204;&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;در مطالعه تجربی حاضر 50 نمونه از کشت&#8204;های مثبت دارای عفونت ادراری ارجاع داده شده به آزمایشگاه بیمارستان &amp;quot;امام رضای&amp;quot; شهرستان بجنورد مورد بررسی قرار گرفت.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; بررسی مقاومت و حساسیت جدایه&#8204;ها با استفاده از روش دیسک دیفیوژن انجام شد. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;حضور&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;ژن&#8204;های&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;tetA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;blaTEM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Sul1&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;aac(3)-IV&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;aadA1&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; نیز &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;مولکولی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;با&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;پرایمرهای&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;اختصاصی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;بررسی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;گردید&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;میزان شیوع مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی، آمپی&#8204;سیلین، کوتریماکسازول، لووفلوکساسین، اسید نالیدیکسیک،&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; سیپروفلوکساسین، جنتامایسین و نیتروفورانتوئین به&#8204;ترتیب معادل 84، 60، 60، 52، 44، 22 و 6 درصد بود. در مجموع، در این مطالعه 50 جدایه باکتری &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;E.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;coli&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; جهت تعیین ژن&#8204;های&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;blaTEM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;،&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;aac&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;(3) -IV&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;،&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;tetA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Sul1&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;aadA1&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; با استفاده از &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Polymerase Chain Reaction&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) مورد بررسی قرار گرفتند که بر مبنای نتایج، فراوانی ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;blaTEM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;aac (3) -IV&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;tetA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;Sul1&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;aadA1&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; به&#8204;ترتیب معادل 24، 12، 10، 8 و 14 درصد بودند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;position:relative;top:-1.0pt;letter-spacing:-.05pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#274CC3;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;روش دیسک دیفیوژن آگار می&#8204;تواند بـه&#8204;عنـوان یـک روش غربـال&#8204;گری اولیه برای تعیین حساسیت آنتی&#8204;بیوتیکی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;برای جدایه&#8204;های &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; جدا&#8204;شده از موارد عفونت ادراری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;color:windowtext;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;به کار رود. برای بررسی دقیق میزان مقاومت جدایه&#8204;ها نیز می&#8204;توان از روش ژنوتیپی استفاده کرد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;strong&gt;Background and Objective:&lt;/strong&gt; Bacterial agents are the most common causes of urinary infection with &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; as the major causative organism. Accordingly, the current study aimed to determine the antibiotic resistance among &lt;em&gt;Escherichia&lt;/em&gt; &lt;em&gt;coli&lt;/em&gt; isolates from human urinary infection cases.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods:&lt;/strong&gt; The current experimental study was carried out on 50 specimens of positive cultures with urinary tract infection referred to Imam Reza Hospital Laboratory in Bojnord, Iran. The resistance and susceptibility of the isolates were assessed using disc diffusion method. Moreover, the presence of &lt;em&gt;tetA&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;blaTEM&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;Sul1&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;aac(3)-IV,&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;aadA1&lt;/em&gt; gens was examined using molecular methods with specific primers.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Prevalence of antibiotic resistance to ampicillin, cotrimaxazole, levofloxacin, nalidixic acid, ciprofloxacin, gentamicin, and nitrofurantoin was measured at 84%, 60%, 60%,52%, 44%, 22%, and 6%, respectively. in total, 50 &lt;em&gt;E. &lt;/em&gt;coli strains were isolated were examined to determine blaTEM, aac(3)-IV, tetA, Sul, and aadA1 genes using polymerase chain reaction(PCR). Based on the obtained results, the frequency of&lt;em&gt; blaTEM&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;aac(3)-IV, tetA&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;Sul1&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;aac(3)-IV&lt;/em&gt;, and &lt;em&gt;aadA1 &lt;/em&gt;genes was reported as 24%, 12%,10%, 8%, and 14%, respectively.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; Disk diffusion agar method can be used as a primary screening method to determine antibiotic susceptibility for &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; isolates separated from urinary tract infections. In addition, genotypic method can be implemented for the accurate evaluation of the resistance of the isolates.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>آنتی‌بیوگرام, عفونت ادراری, مقاومت آنتی‌بیوتیکی</keyword_fa>
	<keyword>Antibiogram, Antibiotic Resistance, Urinary Tract Infection</keyword>
	<start_page>173</start_page>
	<end_page>180</end_page>
	<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-1566-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mohadese</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Amiri </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محدثه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امیری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460012751</code>
	<orcid>100319475328460012751</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hamidreza </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farzin</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حمیدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فرزین</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460012752</code>
	<orcid>100319475328460012752</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Majid  </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Jamshidian-Mojaver</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مجید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جمشیدیان مجاور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mjmojaver@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460012753</code>
	<orcid>100319475328460012753</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
