<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Avicenna Journal of Clinical Medicine</title>
<title_fa>مجله پزشكي باليني ابن سينا</title_fa>
<short_title>Avicenna J Clin Med</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2588-722X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2588-7238</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.53208/ajcm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>-</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1382</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2003</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تعیین نیمه کمی میزان بیان mRNA اینترفرون گاما با استفاده از روش RT-PCR</title_fa>
	<title>In Vitro Semi-Quantitative Determination of Human Gamma-Interferon-mRNA Level by RT-PCR</title>
	<subject_fa>سایر تخصص هاي باليني</subject_fa>
	<subject>Other Clinical Specialties</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original </content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;margin: 0cm -0.05pt 0pt 0cm; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;سایتوکاینها واسطه های شیمیائی هستند که از سلولهای سیستم ایمنی ترشح شده، و بر سلولهای دیگر یا خود سلول ترشح کننده اثر می کنند. بیان متفاوت ژن سایتوکاینها در بدن مشخص کننده نوع پاسخ ایمنی (از نوع &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;Th1&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; یا &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;Th2&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;) است که خود این پاسخ متفاوت می تواند نقش مهمی در پاتوژنز بیماریها داشته باشد. از عمده ترین سایتوکاینهای سلولهای &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;Th1&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; می توان به &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;IFN-&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&amp;gamma;&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;IL-2&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; اشاره کرد. که در پاسخهای ایمنی علیه پاتوژنهای داخل سلولی شرکت می کنند. با توجه به اینکه بیان ژن سایتوکاینها منجمله اینترفرون موقتی بوده و در یک مدت زمان محدود می باشد ، به این علت لازم است&amp;nbsp;بیان ژن آنها (مقدار &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;mRNA&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;) توسط روشهای حساس و دقیقتری همانند &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;RT-PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;اندازه گیری شود .بعلاوه تعیین زمان مورد نیاز جهت ماگزیمم بیان ژن می تواند در مطالعات کلونینگ و&amp;nbsp;استعداد ابتلا به بیماریها در بعضی ازافراد کاربرد داشته باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; بعد از کشت لنفوسیتها در حضور &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;PHA&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; (&lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;Phytohaemagglutinin&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;) ( با غلظت &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;1&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&amp;mu;g/10&lt;/span&gt;&lt;sup&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;6&lt;/span&gt;&lt;/sup&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;cell&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; ) در زمانهای متفاوت (72،0،4،8،12،24،48 ساعت) و استخراج &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;RNA&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; توتال از آنها و سنتز &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;cDNA&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; تک رشته ای اقدام به انجام &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;RT-PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; شد.&amp;nbsp;چون در تمام ساعات انکوبه جواب مثبت بود لذا در مرحله بعدی اقدام به تیتراسیون &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;cDNA&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;حاصل با ضریب رقت&amp;nbsp;1.2 (رقتهای متوالی 1.2، 1.4، 1.8،و&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&amp;hellip;&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;.) شد. بر روی ژل الکترفورز (2%)&amp;nbsp;قطعه مورد نظر (&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;273bp &lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;) مشاهده شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; نتایج بدست آمده از &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;RT-PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;Semi-quantitative-RT-PCR&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; نشان می دهد بعد از چهار ساعت انکوباسیون لنفوسیتها با &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;PHA&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt; ،&amp;nbsp;بیشترین بیان ژن را دارند (تیتر &lt;/span&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;cDNA=512&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;) و معمولاً بعد از گذشت 24 ساعت مقدار آن به سطح اولیه (قبل از تحریک) بر می گردد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;span id=&quot;ctl00_ContentPlaceHolder1_DataList1_ctl00_abstractLabel&quot; style=&quot;font: 12px/15pt tahoma; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;rtl&quot; style=&quot;font-size: 11pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; با توجه به نتایج فوق&amp;nbsp;و مقایسه آن با نتایج محققین دیگر می توان گفت روش&amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;font size=&quot;2&quot;&gt;RT-PCR&lt;/font&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;حساسترین روش سنجش بیان ژن جهت سایتوکاینهاست و بیان ژن اینترفرون بعد از گذشت چهار ساعت انکوبه به ماکزیمم می رسد. بنابر این مدت زمان انکوباسیون با PHA&amp;nbsp;جهت بررسی&amp;nbsp;اثر عوامل مختلف بر تولید و بیان ژن اینتر فرون گاما زمان ایده آلی است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;font: 16px/normal &amp;quot;Times New Roman&amp;quot;; text-align: justify; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;Cells communicate with one another not only by cell-cell contact, but&amp;nbsp;also via the elaboration of soluble mediators or cytokines. The functionally&amp;nbsp;distinct repertoire of secreted cytokines of Th1/Th2 cells has been shown to&amp;nbsp;play an important role in the pathogenesis of inflammatory diseases.&amp;nbsp;Effector Th1 cells secretes predominantly IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; and IL-2 and regulates cell-mediated immunity against intracellular pathogens. Regulatory cytokines&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&amp;nbsp; are likely to be secreted in small quantities in response to specific stimuli and&amp;nbsp;taken by responder cells. As a result, many scientists determine cytokine&amp;rsquo;s&amp;nbsp;m-RNA expression by using a more sensitive technique, RT-PCR.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;font: 16px/normal &amp;quot;Times New Roman&amp;quot;; text-align: justify; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; The expression of IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; -mRNA was studied using semiquantitative RT- PCR. Lymphocytes were stimulated by phytohaemagglutinin (PHA)&amp;nbsp;(1&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;&amp;mu;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;g/10&lt;sup&gt;6&lt;/sup&gt;) in culture medium (incubation time: 0,4,8,12,24,48 and72 hour)&amp;nbsp;and total RNA extracted and cDNA synthesized. IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; was detected by the&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&amp;nbsp; RT-PCR (reverse transcription-polymerase chain reaction) and semi-quantitative-RT-PCR methods, in which sequences (273bp) between two&amp;nbsp;oligonucleotide primers (chosen from two exons of the IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;gene&amp;nbsp;sequences) were amplified using a heat-stable DNA polymerase. In semi-quantitative RT-PCR we used a serial dilution (1/2,1/4&amp;hellip;) of cDNA in order to&amp;nbsp;determine the titer of cDNA for that will give visible band in 2% agarose gel&amp;nbsp; electrophoresis.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;font: 16px/normal &amp;quot;Times New Roman&amp;quot;; text-align: justify; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; Results showed that&amp;nbsp;after 4h incubation express highest level of IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;-&amp;nbsp;mRNA and&amp;nbsp;it is stable until 24 hour after that. Then it falls to baseline level.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;font: 16px/22.66px &amp;quot;Times New Roman&amp;quot;; text-align: justify; color: rgb(45, 135, 179); text-transform: none; text-indent: 0px; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; white-space: normal; widows: 1; font-size-adjust: none; font-stretch: normal; background-color: rgb(247, 246, 243); -webkit-text-stroke-width: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp; In order to study the IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; gene expression kinetic compare results with&amp;nbsp;other studies show that RT-PCR detection of IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma; level is more sensitive than&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;other methods like Elisa and for maximum expression of&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; IFN-&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; &amp;gamma; gene 4h&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;incubation&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; of lymphocytes with PHA&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; is sufficient.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>اینترفرون گاما , لنفوسیتهای فعال شده با PHA , واکنش زنجیره پلیمراز</keyword_fa>
	<keyword>IFN- ? , PHA Activated Lymphocytes , Semi-Quantitative-RT-PCR , Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction</keyword>
	<start_page>5</start_page>
	<end_page>11</end_page>
	<web_url>http://sjh.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2-586&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Jalil</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Tavakol Afshari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa> جلیل </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>توکل افشاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002540</code>
	<orcid>10031947532846002540</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Alireza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zamani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زمانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002541</code>
	<orcid>10031947532846002541</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Javad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Behravan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جواد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa> بهروان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002542</code>
	<orcid>10031947532846002542</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Behrouz</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shisheeyan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بهروز </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شیشه ئیان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002543</code>
	<orcid>10031947532846002543</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Bita</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Saifi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بیتا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa> سیفی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002544</code>
	<orcid>10031947532846002544</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
